讨论是SCI论文的精华部分，是对引言所提出的问题的回答，是将研究结果表象的感性认识升华为本质的理性认识。
在讨论中作者通过对研究结果的思考、理论分析和科学推论，阐明事物的内部联系和发展规律，从深度和广度两方面丰富和提高对研究结果的认识。讨论水平的高低取决于作者的理论水平、学术素养以及专业知识的深、广度。
讨论的内容大致包括以下几个方面：
1、简要的概述国内外对本课题的研究近况，以及本研究的结论和结果与国际、国内先进水平相比居于什么地位。
2、根据研究的目的阐明本研究结果的理论意义和实践意义。
3、着重说明该SCI论文创新点所在，以及本研究结果从哪些方面支持创新点。
4、对本研究的限度、缺点、疑点等加以分析和解释，说明偶然性和必然性。
5、说明该SCI论文未能解决的问题，提出今后研究的方向与问题。并不是每篇SCI论文都必须包括以上内容，应从该论文的研究目的出发，突出重点，紧扣论题。
讨论是最能体现SCI论文水平的一部分，也是写作难度较高的一部分。对于初写者来说，要特别注意如下几点：
1、讨论是作者阐明自己的学术观点，但并不等于是自由论坛，不能泛泛而谈。讨论的内容要从该SCI论文的研究结果出发，围绕创新点与结论展开，要做到层次清晰、主次分明，不要在次要问题浪费笔墨冲淡主题。与文献一致的地方可以一笔带过，重点讨论不一致的地方；引证必要的文献，切忌作文献综述。
2、实事求是、恰如其分的评价，不乱下结论，切忌推理过分外延。医学中有许多尚未阐明的问题，所以推理应非常谨慎，通常冠以“可能”等。
3、任何研究都有其局限性，比如国内的研究结果有待国外验证；体外试验有待于体内试验验证。所以，讨论要坚持一分为二的观点，对于与他人研究结果不一致处要认真分析原因，要抱有虚心追求真理的态度与其他作者讨论，千万不能持“唯我正确”的态度。
4、并不是每篇SCI论文都要有讨论，有的短篇可不写。若结果与讨论关系密切则可放在一起写，合称结果与分析等。
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